Inovativna metoda borbe protiv bolesti usjeva korištenjem lokalnih korisnih bakterija tla nastala je suradnjom znanosti i industrije.
Tim znanstvenika iz Centra John Innes (UK) izolirao je i testirao stotine sojeva bakterija Pseudomonas iz tla prikupljenih s farmi, a zatim sekvencirao genome njih 69.
Uspoređujući genome onih sojeva koji inhibiraju aktivnost patogena s onima koji to ne čine, tim je uspio identificirati ključni mehanizam za zaštitu usjeva krumpira od štetnih bakterija.
Zatim su, koristeći kombinaciju kemije i genetike te nizom eksperimenata, znanstvenici pokazali da je proizvodnja malih molekula zvanih ciklički lipopeptidi važna u suzbijanju krastavosti krumpira (bakterijska bolest koja uzrokuje značajnu štetu na usjevu krumpira). Ove male molekule imaju antibakterijski učinak na patogene bakterije koje uzrokuju krastavost i pomažu korisnim bakterijama Pseudomonas da migriraju i koloniziraju korijenje biljaka.
Eksperimenti su također pokazali da navodnjavanje uzrokuje značajne promjene u genetski raznolikoj populaciji Pseudomonas u tlu.
Studija, objavljena u eLifeu, nudi metodu kojom znanstvenici mogu proučavati mikrobiom gotovo bilo kojeg područja polja i uzeti u obzir različite uvjete tla, agrokemijske i okolišne uvjete.
Koristeći napredak u brzom genetskom sekvenciranju, znanstvenici mogu testirati mikrobiom tla na korisne bakterije i odrediti koje se molekule proizvode za suzbijanje patogena. Sljedeći korak je razmnožavanje i vraćanje korisnih mikroorganizama na isto polje.
Potencijalne primjene pojačivača mikrobioma uključuju primjenu bakterijskih koktela na površinu gomolja u obliku spreja ili izravno u tlo korištenjem navodnjavanja kapanjem.